Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC129Q6ZRS4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms