Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms