Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms