Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C19orf48Q6RUI8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms