Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms