Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms