Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms