Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JMJD6Q6NYC1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms