Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNP1Q6NT89 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms