Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMYD5Q6GMV2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms