Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INTS3Q68E01 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms