Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms