Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms