Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF17Q5VTA0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms