Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms