Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms