Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDSS1Q5T2R2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDSS1Q5T2R2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms