Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms