Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms