Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITRM1Q5JRX3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms