Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI3KQ59H18 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms