Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms