Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms