Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q499Y3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q499Y3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q499Y3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q499Y3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q499Y3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q499Y3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q499Y3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q499Y3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q499Y3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms