Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms