Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HFEQ30201 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms