Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms