Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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