Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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