Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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