Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB3Q16875 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFKFB3Q16875 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms