Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRNQ16849 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRNQ16849 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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