Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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