Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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