Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms