Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1CQ15572 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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