Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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