Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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PTPRKQ15262 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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PTPRKQ15262 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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PTPRKQ15262 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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PTPRKQ15262 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRKQ15262 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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