Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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