Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms