Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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