Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms