Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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