Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A6Q14031 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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COL4A6Q14031 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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COL4A6Q14031 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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COL4A6Q14031 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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