Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK13Q14004 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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