Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NCOA4Q13772 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NCOA4Q13772 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NCOA4Q13772 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NCOA4Q13772 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCOA4Q13772 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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