Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTCH1Q13635 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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