Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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