Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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