Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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